Казахстанским болельщикам Алексей Петрушин известен по работе в алматинском "Кайрате". Под его руководством флагман казахстанского футбола выиграл чемпионат Казахстана в 2004 году. В июле 2005 года после поражения от словацкой "Артмедии" в первом раунде Лиги Чемпионов российский специалист был неожиданно отправлен в отставку.