Сперва распределили команды из корзины лидеров, далее команды со второй корзины. Шахтер был посеян в четвертой корзине, поэтому карагандинский клуб был замыкающим в группе.
В результате жеребьевки Шахтер попал в группу L, в которой его уже ждали АЗ Алкмаар (Голландия), ПАОК (Греция), Маккаби Хайфа (Израиль)
Все группы Лиги Европы
Группа А
1. Валенсия (Испания)
2. Суонси Сити (Англия)
3. Кубань Краснодар (Россия)
4. Санкт-Галлен (Швейцария)
Группа B
1.ПСВ Эйндховен (Голландия)
2. Динамо Загреб (Хорватия)
3. Черноморец Одесса (Украина)
4. Людогорец (Болгария)
Группа C
1.Стандарт Льеж (Бельгия)
2. Зальцбург (Австрия)
3. Эльфсборг (Швеция)
4. Эсбьерг (Дания)
Группа D
1. Рубин Казань (Россия)
2. Уиган (Англия)
3. Марибор (Словения)
4. Зюльте Вареген (Бельгия)
Группа E
1. Фиорентина (Италия)
2. Днепр (Украина)
3. Пасош де Ферейра (Португалия)
4. Пандурий (Румыния)
Группа F
1. Бордо (Франция)
2. АПОЭЛЬ (Кипр)
3. Айнтрахт Фрайбург (Германия)
4. Маккаби Тель-Авив (Израиль)
Группа G
1. Динамо Киев (Украина)
2. Генк (Бельгия)
3. Рапид Вена (Австрия)
4. Тун (Швейцария)
Группа H
1. Севилья (Испания)
2. Фрайбург (Германия)
3. Эшторил Прайя (Португалия)
4. Слован Либерец (Чехия)
Группа I
1. Лион (Франция)
2. Бетис (Испания)
3. Витория (Португалия)
4. Риека (Хорватия)
Группа J
1. Лацио (Италия)
2. Трабзонспор (Турция)
3. Легия Варшава (Польша)
4. Аполлон Лимассол (Кипр)
Группа K
1. Тоттенхэм (Англия)
2. Анжи (Россия)
3. Шериф (Молдавия)
4. Тромсе (Норвегия)
Группа L
1. АЗ Алкмаар (Голландия)
2. ПАОК (Греция)
3. Маккаби Хайфа (Израиль)
4. Шахтер Караганда (Казахстан)