В 1996 году она уже соглашалась занять пост главного тренера сборной Казахстана. Но в 2000-м Нелли Алексеевне пришлось его покинуть. На несколько лет она вообще отошла от волейбола. В 2006 году встала у руля команды по пляжному волейболу - "Алматиночка". Потом с этой командой вернулась в классический волейбол.
Предыдущий главный тренер Виктор Журавлев говорил, что в ближайшие годы команду ждут безрадостные времена, ведь после Пекинской Олимпиады несколько опытнейших волейболисток, в числе которых и капитан Елена Павлова, завершили свои выступления за сборную. А заменить их пока просто некем.
- Без совместной скоординированной работы всех казахстанских тренеров у нас не будет хорошей сборной, - прокомментировала Нелли Щербакова свое назначение. - Поэтому, во-первых, я хочу призвать наставников наших клубов работать в ключе одной концепции. Другое дело, что работать почти не с кем. Из ныне действующих тренеров мне приходят в голову только наставники "Жетысу" и "Астана Канаты" Рустам Масимов и Бахытжан Байтуреев.