Посев сильнейших клубов был произведен для того, чтобы избежать их встреч друг с другом на ранней стадии розыгрыша. Примечательно, что "Актобе" и "Атырау" начнут поход за трофеем со стадии 1/8 финала матчем между собой.
Результаты жеребьевки 1/16 и 1/8 финала Кубка Казахстана-2008.
1/16 финала
1. Каспий (Актау) – Иртыш (Павлодар)
2. Акжайык (Уральск) – Окжетпес (Кокшетау)
3. Казахмыс (Сатпаев) – Тобыл (Костанай)
4. Актобе-Жас (Актобе) – Энергетик-2 (Экибастуз)
5. Булат-АМТ (Темиртау) – Астана (Астана)
6. Карасай Сарбаздары (Алматинская обл.) – Есиль-Богатырь (Петропавловск)
7. Или-Саулет (Алматинская обл.) – Восток (Усть-Каменогорск)
8. Асбест (Житикара) – Кайсар (Кызылорда)
9. Горняк (Хромтау) – Шахтер (Караганда)
10. Тараз (Тараз) – Кайрат (Алматы)
11. Авангард-СКО (Петропавловск) – Жетысу (Талдыкорган)
12. Спартак (Семей) – Ордабасы (Шымкент)
13. Аксу (Степногорск) – Алма-Ата (Алматы)
14. Айжарык (Шымкент) – Мегаспорт (Алматы)
Матчи пройдут 9 апреля на полях команд, указанных первыми.
1/8 финала
Актобе (Актобе) – Атырау (Атырау)
Победитель пары 1 – Победитель пары 2
Победитель пары 3 – Победитель пары 4
Победитель пары 5 – Победитель пары 6
Победитель пары 7 – Победитель пары 8
Победитель пары 9 – Победитель пары 10
Победитель пары 11 – Победитель пары 12
Победитель пары 13 – Победитель пары 14
Матчи пройдут 23 апреля на полях команд, указанных первыми.