Полностью запрещено рыболовство на Черном Иртыше, Бухтарминском водохранилище и озере Маркаколь.
В то же время в акватории озера Маркаколь отведено 4 участка для ограниченного спортивно-любительского рыболовства удочкой. Средства, вырученные от продажи лицензий на любительский лов рыбы, будут направлены на природоохранные мероприятия и научно-исследовательские работы в Маркакольском заповеднике. За незаконный вылов предусмотрен штраф от 2 до 10 месячных расчетных показателей и возмещение ущерба в 1,5 МРП за каждый килограмм рыбы.