Кроме того, законопроектом определен единый орган, ответственный за охрану государственной границы в подводной среде на Каспийском море.
С образованием Таможенного союза и началом функционирования международного Центра приграничного сотрудничества «Хоргос» установлен упрощенный порядок пропуска через государственную границу. Также законопроектом определены условия и пределы применения уполномоченными органами вооружения и военной техники, специальных средств, служебных животных и физической силы при выполнении задач по защите и охране государственной границы.