Три участка железнодорожной дороги в Южно-Казахстанской области Ченгельды-Сарыагаш, Бейнеу-Оазис, Пахтаарал-Джетысай оказались в двойственном положении. Территориальная принадлежность Казахстану сопровождалась управлением железнодорожной компанией “Узбекистон темир йуллари”. Персонал рабочих и служащих станций, состоящий из граждан Казахстана, получал зарплату в сомах.
Для устранения противоречия, возникшего в результате поспешного раздела Среднеазиатской железной дороги в 1991 году, в Ташкенте прошли переговоры руководства национальных компаний КТЖ и “Узбекистон темир йуллари”. Руководство узбекской компании согласилось передать более 100 километров железных дорог Казахстану. После закрепления инициативы на правительственном уровне КТЖ примет переданные линии под свое упралвление.