Документ закрепляет функции секретариата как рабочего органа Комиссии таможенного союза, который организует работу Межгосударственного Совета ЕврАзЭ), Комиссии таможенного союза, а также их информационно-техническое обеспечение.
Соглашение также определяет функциональные особенности и организационную структуру Секретариата, регламентирует порядок набора персонала, специфику деятельности сотрудников Секретариата как международных служащих, вопросы, касающиеся трудовых отношений, пенсионного обеспечения и пособий по социальному страхованию.
Реализация соглашения не потребует дополнительных ассигнований из федерального бюджета.
В ЕврАзЭС входят Белоруссия, Казахстан, Киргизия, Россия и Таджикистан.