До декабря 2003 года Э. Анапияев работал губернатором Иссык-Кульской области. В начале текущего года генеральная прокуратура Кыргызстана предъявила Э. Анапияеву обвинение в незаконном использовании бюджетных средств этой области на сумму 2,3 млн. сомов (около $500 тыс.). По информации руководства генпрокуратуры КР, рассмотрение дела в отношении бывшего губернатора сейчас завершается. Средства незаконно изъятые Э. Анапияевым из Фонда социального развития региона, возмещены полностью.
Органами прокуратуры к уголовной ответственности в Кыргызстане привлечены 284 человека, наделенных должностными полномочиями. Большинству госслужащих инкриминируются взяточничество и должностные преступления.