Е. Казыханов родился в 1964 году в Алматы. Окончил Ленинградский государственный университет им. А. Жданова, по специальности историк-востоковед.
С 1995 по 2000 год являлся советником Постпредства РК при ООН, с февраля 2000 года - директор департамента многостороннего сотрудничества МИД РК. Генеральный секретарь Национальной комиссии РК по делам UNESCO.