В феврале 2002 года ТОО “ТШО” подало иск в Верховный суд РК о признании недействительным постановление правительства РК “Правила выдачи разрешения на загрязнение окружающей среды” от 6 сентября 2001 года, где хранение серы признано загрязнением окружающей среды. 16 марта Верховный суд РК подтвердил законность постановления правительства РК и признал залежи серы, скопившейся на территории ТШО в Атырауской области, отходом производства.
По мнению руководства ТШО, сера является ресурсом компании, который будет использовано в дальнейшем. По информации специалистов министерства, в течение 8 лет ТШО накопило более 5 млн. тонн комовой серы, при этом предприятие не предпринимало никаких мер по переработке и реализации серы. Помимо экологической опасности, по мнению экологов, хранилища представляют также пожаро- и взрывоопасный объект.
По окончании судебного процесса министерство намерено принудить ТШО к разработке программы по утилизации хранящийся серы.