Созданный в Петропавловске по инициативе нескольких горожан, увлеченных изучением природных богатств родного края, музей начал свой временной отсчет с нескольких частных коллекций, собранных под одной крышей. До сих пор посетители музея, ставшего основой создания в конце прошлого века областного музейного объединения, имеют возможность видеть на его стендах бивни мамонта, найденные в Северном Казахстане около ста лет назад.
В связи с юбилеем проходит ряд новых выставок. В беседе с корреспондентом KZ-today директор музейного объединения Ирина Паламарчук высказала сожаление, что значительная часть музейных экспонатов находится в запасниках и посетителям музея-юбиляра из-за тесноты помещений недоступны все богатства исторического наследия, собранные местными специалистами.