В 2002 году агентство было переориентировано на пресечение незаконного вмешательства в предпринимательскую деятельность, правонарушений, сдерживающих развитие законного бизнеса, налоговых преступлений, отменены “валовых показателей” возбуждения уголовных дел. По мнению руководства агентства, смена приоритетов позволила значительно улучшить работу финансовой полиции. В частности, меньше возбуждено уголовных дел по малозначительным фактам. На 32%, с 491 до 333, снизилось количество уголовных дел, возвращенных на доследование. Сократилось количество фактов незаконного привлечения к уголовной ответственности.
Возбуждено более 4 тыс. уголовных дел, относящихся к категории значимых. Количество оконченных уголовных дел по подобным преступлениям увеличилось до 2 тыс. или в 1,7 раза. Из незаконного оборота изъято подакцизной продукции на сумму 810,9 млн. тенге и 3,6 млн. штук поддельных акцизных марок, что в 7 раз превышает показатели 2001 года. По фактам незаконного использования чужого товарного знака окончено производством 18 уголовных дел. Ранее такие дела не расследовались.
В суд направлено 41 уголовное дело по фактам злоупотребления должностными полномочиями, 26 дел по фактам превышения власти, 43 дела по фактам взяточничества.