Основные приоритеты сотрудничества: новая европейская политика здравоохранения - «Здоровье-2020», укрепление системы здравоохранения, усиление профилактики неинфекционных заболеваний с акцентом на здоровый образ жизни, также инфекционных болезней, безопасность общественного здоровья и окружающая среда, а также обмен информацией, статистическими данными, разработка научных исследований и внедрение инноваций в области здравоохранения.