С начала 2001 года департаментом было возбуждено 562 уголовных дела. В прокуратуру было направлено 256 уголовных дел с обвинительным заключением. Финансовой полицией на транспорте было выявлено 47 коррупционных преступлений среди государственных чиновников. В частности, в настоящее время в производстве прокуратуры находится уголовное дело в отношении бывшего председателя налогового комитета по Алматинской области. По данным полиции, он, не изучив полученные материалы, санкционировал незаконный возврат средств из государственного бюджета частному коммерческому предприятию на сумму 31 млн. тенге.
Также было выявлено 141 преступление против собственности, 72 административных правонарушения, 96 правонарушений налогового и административного законодательства в сфере оборота подакцизной и продукции. Из незаконного оборота было изъято подакцизной продукции на сумму 34,29 млн. тенге.
В настоящее время департамент финансовой полиции структурно состоит из трех межрегиональных управлений на транспорте в Центральном, Западном и Юго-Восточном регионах и двух межрайонных отделов по Восточному и Каспийскому регионам. В обслуживании департамента находятся железнодорожный, автомобильный и водный транспорт, аэропорты и морской порт Актау.